Salah satu tantangan mempertahankan ekosistem mangrove, rehabilitasi, maupun dalam pemanfaatan mangrove untuk tujuan produktif adalah belum optimalnya pendekatan pembangunan inklusif, kerjasama antar pelaku usaha dan kewilayahan. Pusat Studi Ekonomi Kerakyatan (PSEK), Universitas Gadjah Mada sejak berdiri telah mengembangkan berbagai kajian aksi (action-research) dan berhasil mengembangkan model-model pengembangan SDM dan kelembagaan di beberapa sektor, yang fokus utamanya pada pengembangan kesadaran.